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评述:一种用于大尺寸组织透明化样品的新型浸液显微物镜

2024-01-02 11:394770

撰稿人 |  薪胆居士


论文题目 | Reflective multi-immersion microscope objectives inspired by the Schmidt telescope


作者Fabian F. Voigt, Anna Maria Reuss, Thomas Naert, Sven Hildebrand, Martina Schaettin, Adriana L. Hotz, Lachlan Whitehead, Armin Bahl, Stephan C. F. Neuhauss, Alard Roebroeck, Esther T. Stoeckli, Soeren S. Lienkamp, Adriano Aguzzi & Fritjof Helmchen?


完成单位 | 美国哈佛大学

研究背景

      自16世纪显微镜被发明以来,经过广大科研工作者的不懈努力,性能越来越强,种类也越来越多。随着21世纪以来科技的快速发展,类似于组织透明化的新技术不断涌现,对显微成像技术提出了新的挑战。

      近十年来,在生物医学领域,将小鼠脑部(≈1cm3)整体透明化加以研究已经成为了常态,甚至已经实现了人类器官的透明化。对这些大尺寸透明化样本的观测要求显微物镜的数值孔径(NA)得高、工作距离(WD)要长、视场(FOV)也必须够大。此外,常见的组织透明化分为有机溶剂透明技术、亲水性试剂透明技术、水凝胶包埋组织透明技术三类。它们所用透化剂多种多样,即使同一技术使用的化学试剂也可能不同,折射率覆盖范围很广(1.33~1.56)。现有的商业物镜虽然针对性的研制出了校正环,但在普适性上仍有不足之处。

论文导读

      21世纪以来,随着社会的快速发展,人们的生活条件越来越好,对健康问题的重视程度也越来越高。因此,生物医学研究领域受到了国家的重点关注,有多个研究方向列入了《国家自然科学基金“十四五”发展规划》中的优先发展领域名单,如脑科学和类脑模型等。

      在生物医学领域,对大脑等生物器官、组织甚至是细胞的结构和功能的研究离不开显微成像技术。但是,绝大多数的生物组织都是不透明的。显微镜只能让人看见表面,看不见内部。在很长的一段时间内,人们不得不通过切片、固定、染色等步骤来解决这一问题。目前,此类组织学方法仍然是癌症诊断的“金标准”。问题在于,切片是一个劳动密集型工作,切片行为可能对微观结构造成一定的破坏,而且切出来的样本仅能提供二维信息。虽然多个切片联合在一起可以实现一定程度上的三维成像,但是在深度方向上的空间分辨率通常不是很高。那么有没有办法能够不做切片,直接观测到生物组织的整体结构呢?

      为了解决这一问题,学者们发明了组织透明化技术(tissue clearing 或 tissue optical clearing)。组织透明化技术利用化学试剂浸泡样品,去除或溶解组织中的脂质,使得生物组织的光散射和光吸收最小化,从而变得透明,以真正实现样品的三维显微成像。透明化后可以通过组织细胞特异性标记以及显微镜观察与统计,对目标蛋白、核酸、亚细胞结构等进行明确的定性、定位和定量分析。

      常见的生物显微镜多用来观察组织切片,放大倍率越大,物镜和样本之间的成像距离越近。组织透明化的优势就在于可以对生物组织进行整体观测,而大脑等生物组织的尺寸都比较大,很难塞到常规生物显微镜下去观察。因此,组织透明化相关的研究需要用到专用的显微镜,如光片显微镜(Light-sheet microscopy)。

      美国哈佛大学分子与细胞生物学系的Fabian F. Voigt等人以扇贝的眼睛为蓝本,提出了一种由施密特望远镜改造而来的新型浸液显微物镜,为大尺寸组织透明化样品的研究提供了强有力的科研工具。相关成果以Reflective multi-immersion microscope objectives inspired by the Schmidt telescope为题发表在Nature Biotechnology上。

技术突破

      该文的通信作者,分子生物学家Fabian F. Voigt在阅读一本关于动物视觉的书时,发现扇贝的眼睛结构与众不同,如图1a所示。与常见动物只有两只眼睛不同,扇贝在外壳边缘的外套膜内长有200多只蓝色的小眼睛。成像的原理也有其独特之处:光线经过瞳孔,由晶状体稍作会聚,穿过视网膜后由一个类似凹面镜的银膜层进一步聚焦,再次反射回视网膜形成清晰地像。以此看来扇贝的“眼睛们”相当于一个施密特望远镜阵列。这一特点使得扇贝具有250度的视角和绝佳的水下视力,甚至能看清藻类孢子、有机碎屑和几乎透明的浮游生物。

      回到显微物镜这边来,物镜是通过折射来聚焦成像的,其数值孔径与周边环境的折射率成正比。因此,通过浸入高折射率液体的方式实现大数值孔径成像属于常规操作。但是,对于组织透明化应用来说,由于浸泡样本的透化剂不同,折射率差异大,因此显微物镜的数值孔径也随之变化,进而影响像差校正,引发图像劣化。设计更加复杂的物镜结构,引入校正环或者调整物镜内部透镜组位置可以部分解决这一问题,但又引出了成本和价格问题。

      借鉴扇贝眼睛的特点,如果使用凹面镜来聚焦成像,反射光的路径、焦点和单色像差不受环境折射率的影响,就可以避免透化剂对成像质量的影响了,如图1c所示。此外,在数值孔径相同的前提下,反射成像的工作距离更长,因此非常适合用来做透明化组织的成像。

图1 施密特物镜的概念图。a.本文的创新思路主要来源于扇贝眼睛的解剖结构。其主要成像部件不是常见的角膜和晶状体,而是凹面反射镜。b.本文灵感的第二个来源是施密特望远镜。它由一个非球面校正镜片和一个凹面镜组成,是一种宽视场反射式望远镜。c.两种概念合成为施密特物镜。利用校正镜片来保证激励光束正入射,减小像差。

      该文作者通过以下几步将施密特天文望远镜转变为浸液显微物镜:1、将天文望远镜的米级孔径缩小到适合显微镜的厘米级孔径;2、用荧光标记的样品替换望远镜焦点处的成像器件;3、不再聚焦来自恒星的光,改为聚焦和扫描激励光;4、用液体填充凹面镜和校正镜片之间的空间;5、为了解决校正镜片和填充液体的交界面处引入的像差问题,作者将校正镜片的迎光面设计成消球差的形状,背光面的形状(作者称其为‘微折射’表面)则保证激励光可以垂直出射。这样的一个校正镜片可以适用于各种不同折射率的填充液体,解决普适性问题。之所以叫做‘微折射’是因为对透明化样品的显微成像常会用到激光扫描系统,物镜处的扫描角度一般仅为几度,引发的微小折射仍可保证该物镜有毫米级的视场。作者将这种新型显微物镜称为‘施密特物镜’。

      在实际操作中,作者用理论分析和Zemax光学仿真对施密特物镜的结构进行了优化设计。校正镜片和凹面镜都是石英玻璃材质。凹面镜镀铝膜,直径3cm。工作距离,即从凹面镜外缘到焦点的距离,为11mm;入瞳直径22mm;用水做填充时,NA=0.92,FOV=1.4mm;填充液体为ECI,DBE或BABB这些折射率为1.56的透化剂时,NA=1.08,FOV=1.1mm。

      对透明化样本成像的实验装置如图2a所示,施密特物镜如图2c所示。采用波长范围为750-1000nm的可调谐掺钛蓝宝石飞秒激光器作为光源。激励光穿过电光开关后由一个伽利略望远镜扩束;两个扫描振镜将其导入一个4F光学系统进行准直;激励光束穿过校正镜片后被凹面镜反射聚焦到样本上;穿过样本的激励光和激发出的荧光出射后,荧光被NIE/VIS二向色滤光片分离出来聚焦到光电倍增管上。

图2 显微成像实验总览。a.显微镜结构图,凹面镜被固定在一个三维平移台上以便于调整其位置获得最佳成像效果。b.物镜的浸液腔和凹面镜。c.组装好的施密特物镜。d.尺寸为200nm的荧光微球的成像效果。FS和Type A为不同种类的Cargille浸镜油。NA与n成正比,轴上点扩散函数PSF与n成反比。e.振镜扫描角±1.75°时的PSF和FOV。FOV与n成反比。

      该文首先利用尺寸为200nm的荧光微球来测试施密特物镜的性能。激光器的工作波长为800nm。浸液腔空置时轴上点扩散函数(PSF)为0.56±0.01μm(x轴,mean±s.e.m.)、0.49±0.07μm(y)、1.93±0.1μm(z);使用水作为填充液体时,PSF为0.42±0.04μm(x)、0.43±0.03μm(y)、1.65±0.1μm(z);使用折射率为1.45的浸镜油时,PSF为0.36±0.01μm(x)、0.33±0.01μm(y)、1.33±0.09μm(z);使用折射率为1.51的浸镜油时,PSF为0.36±0.02μm(x)、0.32±0.02μm(y)、1.36±0.01μm(z);在整个折射率范围内,PSF接近衍射极限。在视场方面,因为光束扫描时的‘微折射’引入的离轴像差和衍射限制,振镜扫描角度为±1.75°,在空气、水和两种浸镜油中的FOV如图2e所示。数值孔径如图2d所示。

      作者使用施密特物镜对多种透明样品进行了显微成像以展示其性能,包括:花粉团表面特征(图3a,浸液腔空置)、5日龄斑马鱼幼虫的神经活动(图3b,水填充)、透明化的3日龄蝌蚪的视网膜(图3c,BABB填充)、小鼠脑部4mm厚切片的神经树突(图3d,DBE填充)、人脑新皮质的神经元胞体(图3d,5×7×4mm3,ECI填充)。

图3 施密特物镜的显微成像结果。样品固定好后会先用片光显微镜成像,再用施密特物镜成像以作对比。a.在空气中给花粉团成像的结果。b.在水中对5日龄斑马鱼做功能成像的结果。c.在BABB中对透明化蝌蚪的头部和视网膜成像的结果。d.在DBE中对冠状小鼠脑切片的神经元树突成像的结果。e.在ECI中对人类新皮质的神经元胞体成像的结果。

观点评述

      该文以扇贝的眼睛和施密特天文望远镜为参考,发明了一种新的浸液显微物镜——“施密特物镜”。文中对所有样本的实验操作和化学处理有必要的论述。线上资料中有相关研究和实验的视频。在论文的支撑材料中还有理论分析和光学仿真的内容。

      虽然施密特物镜只有三个光学表面,但具有工作距离长、数值孔径高、视场大的特点,非常适合用来做大尺寸透明化样本的研究。该物镜结构简单成本不高,却能在理论上适用于各种具有不同折射率的浸润液体。因此,该成果对生物医学领域有着重要的实用价值。

      此外,作者由一个偶然的发现激发出灵感,再经过科学的思考确定研究方案,接着利用理论分析和数值模拟优化结构,最后利用实验加以验证。该文有新的基于仿生学的光学设计思想,做出了具体的器件并加以应用,是一个有代表性的科研案例,具有重要的学术价值。

本文出处

发表于:Nature Biotechnology

论文链接:

https://www.nature.com/articles/s41587-023-01717-8

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